Ecole Thématique CNRS
Station Biologique de Roscoff
27 sept. - 01 oct. 2010
L’école se déroulera à la Station Biologique du CNRS de Roscoff. Les participants bénéficieront de l’hébergement sur place, dans la structure d’accueil, et des infrastructures de formations (amphithéâtre et salle de travaux pratiques).
Cette école s'adosse à l'activité du projet transverse RENABI GRISBI.
Informations Pratiques
Un plan d'accès est disponible en ligne, ainsi qu'un plan de situation des différents sites où se déroulera l'école. Afin d’organiser les liaisons depuis l’aéroport (BREST) et la gare la plus proche (MORLAIX), les participants sont invités à contacter les organisateurs pour leur indiquer leurs horaires d’arrivée et de départ avant le 3 septembre 2010.
Contact
Christophe BLANCHET
- 04 72 72 26 71
Christophe CARON
- 02 98 29 25 43
mél: grisbi-ecole2010@ibcp.fr
Inscriptions
L'école est ouverte aux personnels du CNRS, ingénieurs et scientifiques, des autres EPST et EPIC, ainsi qu'aux personnels du secteur privé. Le nombre de participants est limité à 25. La priorité sera donnée aux agents CNRS.
Modalités: Téléchargez la plaquette de présentation et le bulletin d’inscription. La date limite est le 30 juin 2010.
Comité scientifique
Claudine MEDIGUE (RENABI)
Bernard KLOAREG (GenOuest)
Antoine De DARUVAR (CBiB)
Gilbert DELEAGE (CNRS INSB)
Christian GAUTIER (PRABI)
Jean-François GIBRAT (MIGALE)
Richard LAVERY (PRABI)
Jacques NICOLAS (GenOuest)
Olivier POCH (BIPS)
El Ghazali TALBI (CIB)
Comité d'organisation
Christophe BLANCHET (PRABI)
Christophe CARON (GenOuest)
Olivier COLLIN (GenOuest)
Tiphaine MARTIN (CBIB)
Frédéric PLEWNIAK (BIPS)
Nouredine MELAB (CIB)
Franck SAMSON (MIGALE)
Bruno SPATARO (PRABI)
Soutien Financier
CNRS INSB - Centre National de la Recherche Scientifique - Institut national des Sciences Biologiques
Et également: RENABI - IBISA - Institut des Grilles - Association Aristote - GDR BIM
GRISBI – Calcul Scientifique sur Grille pour la Bioinformatique
Préparer l’Infrastructure de Recherche pour la Bioinformatique de demain maintenant !
Tous les documents sont librement accessibles sur ces pages.
L ‘école « Calcul Scientifique sur Grille pour la Bioinformatique » s'articulera autour des besoins bioinformatiques concernant l'intégration des données biologiques et des outils avec une plateforme informatique à large échelle.
La Bioinformatique requiert maintenant des infrastructures de recherches permettant le stockage de grandes quantités de données, complexes et hétérogène, et le calcul massif pour leur analyse. Dans ce contexte nous pouvons tirer un avantage certain des nouveaux développements en informatique du calcul intensif et du stockage massif: cluster de calcul, grille de calcul et de données, architecture dédiée (FPGA, GPU, Cell), cloud computing. Ces infrastructures informatiques distribuées ou à haute performance sont le champs d'intégration potentiells des outils existants pour l'analyse de données massives, et leur mise à disposition de la communauté plus efficacement et de manière plus transparente (portail, Web services, workflow).
Perspectives
Les retombées attendues sont de diffuser les compétences d’utilisation d’une infrastructure de Recherche de type grille auprès des plateformes nationales et des laboratoires de Bioinformatique. Les scientifiques et ingénieurs se trouvent actuellement confrontés à des applications biologiques requérant de grandes ressources informatiques, difficultés auxquelles une infrastructure de grille peut répondre.
Programme
Les grands axes du programme sont :
- Identification des besoins de la Biologie,
- présentation des initiatives concernant les infrastructures nationales pour la Recherche,
- retour d'expériences bioinformatiques réalisées sur grille, Web services et cloud computing.
Ces thèmes donneront lieu à des travaux pratiques conduits par les experts du domaine.
