Infrastructure RENABI GRISBI

L'infrastructure RENABI GRISBI est une initiative conjointe entre plusieurs plateformes nationales de Bioinformatique, collaborant dans le cadre du réseau RENABI : PRABI Lyon, RENABI-GO Rennes et Roscoff, RENABI-SO Bordeaux et Toulouse, RENABI-NE Strasbourg et Lille, APLIBIO Jouy-en-Josas. La vocation de la plateforme GRISBI est de permettre la réalisation d'expériences traitant de systèmes biologiques de grande taille dans des domaines comme l'analyse de données NGS, la génomique comparative, l'analyse de séquences ou de structures à grande échelle. Les sites initiaux de GRISBI travaillent à partager et à relier leurs ressources nationales, dédiées à la Bioinformatique, à l’aide de composants logiciels de type grille : le stockage et leurs ressources de calcul proprement dit, mais également leurs bases de données et leurs logiciels.

RENABI GRISBI organise le 26 mai 2011 une journée de présentation ouverte à la communauté. Cette journée fera la synthèse des besoins bioinformatiques relevant d'une infrastructure distribuée, et présentera  les moyens mis en oeuvre au sein de RENABI GRISBI pour les satisfaire en terme d'intégration des données et des logiciels. L'objectif de cette journée est d'introduire l'infrastructure distribuée RENABI GRISBI, et de présenter ses fonctionnalités actuelles. Le programme est disponible en ligne sur le site www.grisbio.fr .

Cette journée sera suivie le 27 mai 2011 d'un tutoriel sur l'utilisation de l'infrastructure distribuée RENABI GRISBI. Cette formation est destinée aux chercheurs et ingénieurs désirant avoir une première expérience avec cette infrastructure. Il est demandé d'avoir une certaine habitude à l'utilisation d'un cluster de calcul et de la ligne de commande Unix/Linux. La participation au tutoriel est limitée à 30 personnes, les premiers inscrits seront retenus.

L'inscription est gratuite mais nécessaire pour des questions d'accès aux sites et de logistique. Le formulaire est disponible en ligne sur le site Web de RENABI GRISBI.